A segunda passagem de Neymar pelo Santos, iniciada em janeiro, foi rodeada de expectativas tanto positivas quanto negativas. O retorno do atacante ao clube ficou marcado por jogadas brilhantes, porém, por números abaixo do esperado e uma série de lesões que comprometeram significativamente seu desempenho em campo. A sua despedida ocorreu de forma inesperada, durante a derrota por 1 a 0 para o Botafogo na Vila Belmiro. Com contrato até 30 de junho, Neymar foi expulso na partida realizada em 1º de outubro, correspondente à 11ª rodada do Campeonato Brasileiro. Reconhecendo o impacto de suas ações, o jogador publicou um pedido de desculpas em suas redes sociais.
Neymar expressou seus arrependimentos, afirmando que a pressa em marcar o gol levou a erros. Ele pediu desculpas aos companheiros de equipe e aos torcedores, destacando que, caso não tivesse sido expulso, acredita que a equipe teria conseguido garantir os três pontos da partida. Apesar da expulsão, o time teve um desempenho elogiável no jogo. O incidente que resultou no cartão vermelho aconteceu aos 29 minutos do segundo tempo, quando Neymar, ao tentar marcar um gol após um rebote, foi punido após já haver recebido um cartão amarelo anteriormente. Com um jogador a mais, o Botafogo conseguiu marcar seu gol aos 41 minutos do segundo tempo.
Neymar assinou contrato com o Santos em 31 de janeiro, após rescindir seu vínculo com o Al Hilal, da Arábia Saudita. A expectativa era de que ele pudesse reencontrar seu melhor futebol no clube onde iniciou sua carreira. Entretanto, sua trajetória foi curta e cheia de altos e baixos. Em 2025, ele participou de apenas 12 jogos oficiais com a camisa do Santos, contabilizando competições como o Campeonato Paulista, Campeonato Brasileiro e Copa do Brasil. Durante esse período, o atacante anotou 3 gols e forneceu 3 assistências, todas elas no Campeonato Paulista, totalizando cerca de 713 minutos em campo, com uma média de aproximadamente 60 minutos por jogo.
Embora sua produtividade tivesse potencial, os episódios de lesões frequentes diminuíram seu impacto na equipe. Neymar chegou ao Santos já enfrentando limitações físicas, tendo se recuperado de uma grave lesão no joelho sofrida enquanto estava na seleção brasileira. A primeira contusão relevante após seu retorno ocorreu em 2 de março, durante uma partida contra o Bragantino, quando sofreu uma lesão na coxa que o afastou da semifinal do Campeonato Paulista. Após um período de recuperação, o atacante voltou ao time, mas sua alegria foi efêmera.
Em 16 de abril, numa partida contra o Atlético Mineiro, que marcava suas 100 aparições pelo Santos, Neymar sofreu nova lesão na coxa esquerda e deixou o campo visivelmente emocionado. Essa lesão pôs o jogador fora das competições novamente, com estimativas iniciais indicando um tempo de recuperação de quatro a seis semanas. A recorrência de lesões musculares levantou questões sobre a condição física do atleta e sua capacidade de lidar com a intensidade do calendário do futebol brasileiro. Tanto a diretoria do Santos quanto a equipe médica do jogador manifestaram, em diversas ocasiões, a necessidade de um cuidado especial para que ele pudesse se recuperar completamente.